Clean URL + Free.fr + Drupal 5.x : une solution

<?php
$url = $_SERVER['REQUEST_URI']; // On récupère l'URL demandée

if(preg_match("^(.*)$/", $url, $match)) // (*) "/^\/dir\/to\/drupal\/(.*)$/"
{
    header("HTTP/1.1 200 OK");
    $url = $match[1];
    $start_query = strpos($url, '?');
    if ($start_query !== FALSE) {
        $path = substr($url, 0, $start_query);
        $query = "q=" . $path . "&" . substr($url, $start_query + 1);
    }
    else {
        $path = $url;
        $query = "q=" . $path;
    }
    $params = explode("&", $query);
    foreach($params as $p) {
        $fields = explode("=", $p);
        $key = $fields[0];
        $value = $fields[1];
        $_GET[$key] = $value;
        $_REQUEST[$key] = $_GET[$key];
    }
    $_SERVER["REDIRECT_STATUS"] = 200;
    $_SERVER["REDIRECT_URL"] = $url;
    $_SERVER["QUERY_STRING"] = $query;
    $_SERVER["SCRIPT_NAME"] = "/index.php"; // (*) "/dir/to/drupal/index.php"
    $_SERVER["SCRIPT_FILENAME"] = $_SERVER['DOCUMENT_ROOT'] . $_SERVER["SCRIPT_NAME"];
    $_SERVER["PHP_SELF"] = $_SERVER["SCRIPT_NAME"];
    // chdir("dir/to/drupal"); // (*)
    include("index.php");
    exit();
}
/* Erreur 404: compléter par le code PHP ou HTML à utiliser pour les "vraies" pages non trouvées (autres que celles gérées par drupal)*/
...
?>

<?php
// [...]

/<strong>
 * Format a hidden form field.
 *
 * @param $element
 *   An associative array containing the properties of the element.
 *   Properties used:  value, edit
 * @return
 *   A themed HTML string representing the hidden form field.
 */
function theme_hidden($element) {
  // Patch free.fr
  if ($element['#name'] == 'attach-url') {
      $element['#value'] = patch_clean_url_exception($element['#value']);
  }
  // End patch free.fr
  return '<input type="hidden" name="'. $element['#name'] . '" id="'. $element['#id'] . '" value="'. check_plain($element['#value']) ."" " . drupal_attributes($element['#attributes']) ." />\n";
}

// [...]

/</strong>
 * Format a form.
 *
 * @param $element
 *   An associative array containing the properties of the element.
 *   Properties used: action, method, attributes, children
 * @return
 *   A themed HTML string representing the form.
 */
function theme_form($element) {
  // Patch free.fr
  $element['#action'] = patch_clean_url_exception($element['#action']);
  // End patch free.fr
  // Anonymous div to satisfy XHTML compliance.
  $action = $element['#action'] ? 'action="' . check_url($element['#action']) . '" ' : '';
  return '<form '. $action . ' method="'. $element['#method'] .'" '. 'id="'. $element['#id'] .'"'. drupal_attributes($element['#attributes']) .">\n<div>". $element['#children'] ."\n</div></form>\n";
}

/**
 * Patch free.fr
 *
 * permet d'utiliser la méthode POST sur les pages dont l'URL a été réécrite (option clean_url=1)
 * lorsque cette option est positionnée, les formulaires qui ont pour destination des url réécrites
 * sont traités par le script d'exception 404 mod_rewrite.php qui interdit la méthode POST. Le patch
 * consiste à forcer les formulaires utilisant POST à débrayer l'option clean_url durant la soumission
 * du formulaire.
 *
 * Deux cas se présentent:
 * - attribut action de <form> => modifié dans theme_form()
 * - champ caché contenant une URL => modifié dans theme_hidden()
 */
function patch_clean_url_exception($uri){
  global $base_url;
  $script = 'index.php';
  $abs_path = $base_url . "/";
  $base_path = base_path();
  if ($uri && (strlen($uri) > 0)) {
      $path = $uri;
      // trim base if any
      if (strcmp($abs_path, substr($path, 0, strlen($abs_path))) == 0) {
          $path = substr($path, strlen($abs_path));
      }
      elseif (strcmp($base_path, substr($path, 0, strlen($base_path))) == 0){
          $path = substr($path, strlen($base_path));
      }
      // trim script if any
      if (strcmp($script, substr($path, 0, strlen($script))) == 0) {
          $path = substr($path, strlen($script));
      }

      if (substr($path, 0, 1) != '?') {
          // option clean_url débrayée sur cette URL
          $uri = $base_path . "?q=" . preg_replace('/\?/', '&', $path, 1);
      }
  }
  else {
      // base url forcée car on ne sait pas de quelle page on vient
      $uri = $base_path . "?q=" . $_GET['q'];
  }
  return $uri;
}
?>